ABSTRACT
Construímos um banco de referência näo redundante de fatores de regulaçäo da transcriçäo do tipo bZIP a partir de dados do genôma de Arabidopsis thaliana. Os fatores bZIP de Arabidopsis foram ordenados em treze famílias de proteínas evolutivamente relacionadas e essa classificaçäo foi usada para organizar os cDNAs de cana de açúcar que codificam proteínas bZIP. Além disso, mostramos que essa classificaçäo poderá ser útil para definir "Putative Clusters of Orthologous Groups" de reguladores bZIP de plantas superiores.
Subject(s)
Arabidopsis , Gene Expression Regulation , Phylogeny , Plant Proteins , Plants , Transcription FactorsABSTRACT
A N-glicosilaçäo é uma das principais modificações pós-tradicionais, sendo responsável por alterações na conformaçäo, estabilidade e conseqüentemente na funcionalidade de proteínas em eucariotos. Com a finalidade de melhor compreender a via de N-glicosilaçäo em plantas foi realizada uma prospecçäo no banco de seqüências expressas do projeto genoma da cana de açúcar (SUCEST). Foram identificadas noventa seqüências cujos produtos gênicos apresentam alto grau de similaridade com enzimas envolvidas na biossíntese e processamento de N-glicanos. Dos vinte e três genes da via de N-glicosilaçäo previamente descritos em diferentes espécies, vinte e um foram detectados em cana de açúcar.